Search Results

스토리지 전략 및 성능 최적화 3.1 HealthOmics 스토리지 아키텍처 공유 파일시스템 특성: HealthOmics 런타임 환경: - EFS (Elastic File System): 기본 공유 스토리지 - FSx for Lustre: 고성능 워크로드 옵션 - Run별 공유: 동일 Run 내 모든 Task가 파일시스템 공유 - 네트워크 레이턴시: 1-5ms (EFS), <1ms (FSx Lustre) DYNAMIC vs STATIC 스토리지 전략: DYNA...

리소스 요구사항 및 TCO 분석 4.1 워크로드별 리소스 프로파일 Phase 1: Data Processing QC 리소스 요구사항: - CPU: 8-16 cores (NTSM 병렬 처리) - Memory: 32-64 GB (k-mer 데이터베이스) - Storage: 200-400 GB (압축 해제 + 중간 파일) - 실행 시간: 2-4시간 - 병렬성: 샘플별 독립 실행 가능 HealthOmics 권장 설정: - vCPU: 16 - Memory: 64 GB ...

보안 및 IAM 전략 5.1 HealthOmics IAM 아키텍처 서비스 연결 역할 (Service-Linked Role): { "Version": "2012-10-17", "Statement": [ { "Effect": "Allow", "Principal": { "Service": "omics.amazonaws.com" }, "Action": "sts:AssumeRole" } ]...

모니터링 및 운영 전략 6.1 CloudWatch 메트릭 및 알람 핵심 모니터링 메트릭: HealthOmics 메트릭: - RunDuration: 워크플로우 실행 시간 - TaskFailureRate: 태스크 실패율 - StorageUtilization: 스토리지 사용률 - ComputeUtilization: CPU/메모리 사용률 비즈니스 메트릭: - SamplesProcessedPerDay: 일일 처리 샘플 수 - AverageProcessingCost: 샘...

구현 로드맵 및 마이그레이션 전략 7.1 4단계 구현 접근법 Phase 1: 기반 인프라 구축 (2-3주) Week 1: AWS 환경 준비 Day 1-2: 계정 설정 및 권한 구성 - AWS Organizations 구조 설계 - HealthOmics 서비스 활성화 - 서비스 한도 증가 요청 (vCPU, 스토리지) Day 3-5: 네트워킹 및 보안 - VPC, 서브넷, 보안 그룹 구성 - IAM 역할 및 정책 생성 - KMS 키 생성 및 권한 설정 Day 6...

도전과제 및 해결방안 8.1 기술적 도전과제 도전과제 1: WDL 워크플로우 호환성 문제 문제 상황: HealthOmics 런 실패 사례 (Run ID: 7924563): OutputError: task outputs attempted to use a path outside its working directory: output_final/NA20799.m64306Ue_220927_182256.dc.q20.fastq.gz 근본 원인: - 심볼릭 링크가 작업 디렉...

모범 사례 및 권장사항 9.1 개발 및 테스트 전략 소규모 테스트 데이터셋 우선 접근: 권장 테스트 데이터 크기: - 개발 단계: 1-5GB (빠른 반복) - 통합 테스트: 10-20GB (중간 규모) - 성능 테스트: 50-100GB (실제 규모) - 프로덕션 검증: 전체 규모 (200GB+) 이유: - 디버깅 시간 단축 (30분 vs 24시간) - 비용 절약 (개발 단계 90% 절감) - 빠른 피드백 루프 - 리소스 요구사항 정확한 측정 miniWDL 기...

FAQ 및 결론 10.1 자주 묻는 질문 (FAQ) Q1: HealthOmics와 AWS Batch 중 어떤 것을 선택해야 하나요? A: 다음 기준에 따라 선택하시기 바랍니다: HealthOmics 선택 시나리오: 완전 관리형 솔루션 선호 Genomics 워크로드 특화 기능 필요 운영 오버헤드 최소화 원함 규정 준수 요구사항 높음 (HIPAA, SOC 2) 월 50+ 샘플 처리하는 프로덕션 환경 AWS Batch 선택 시나리오: 기존 Cromwell 인프라...

HPP Production Workflows - 실전 트러블슈팅 가이드 개요 본 문서는 HPP Production Workflows를 AWS HealthOmics에서 실행할 때 발생할 수 있는 실제 문제들과 해결 방법을 다룹니다. 실제 프로덕션 환경에서 발생한 사례들을 바탕으로 구체적인 해결책을 제시합니다. 1. WDL 워크플로우 호환성 문제 문제 1: OutputError - 작업 디렉토리 외부 경로 참조 에러 메시지: OutputError: task out...