Advanced Search
Search Results
81 total results found
eGovFramework on AWS
Nextflow
AWS BLAST Performance Testing
AWS에서 BLAST(Basic Local Alignment Search Tool) 워크로드를 위한 성능 테스트 및 비용 최적화 가이드입니다. EFS, EBS, FSx for Lustre 스토리지 옵션 비교 및 AWS Batch 기반 아키텍처를 다룹니다.
공유 AMI로부터 가상 머신 시작하기
AMI 소개 Amazon Machine Image(AMI)는 인스턴스를 시작하는 데 필요한 정보를 제공하는 AWS에서 지원되고 유지 관리되는 이미지입니다. 인스턴스를 시작할 때 AMI를 지정해야 합니다. 동일한 구성의 인스턴스가 여러 개 필요할 때는 한 AMI에서 여러 인스턴스를 시작할 수 있습니다. 서로 다른 구성의 인스턴스가 필요할 때는 다양한 AMI를 사용하여 인스턴스를 시작할 수 있습니다. AMI에 관한 보다 자세한 사항은 AWS 공식문서의 다음 링크...
저장 장치 추가하기
생성된 EC2 인스턴스에는 운영 체제를 지원하기에 충분한 저장 용량을 갖춘 루트 볼륨과 분석을 지원하는 데 필요한 몇 가지 추가 애플리케이션이 있습니다. 대용량 데이터(예: Raw reads, aligned sequences 등)를 EC2 인스턴스를 통해 다운로드 하려면 추가 스토리지가 필요할 수도 있습니다. 따라서 추가 스토리지를 연결해야 합니다. 이 섹션에서는 다음과 같이 설명합니다: a. EBS(Elastic Block Store) 볼륨을 생성합니다....
Amazon Lightsail for Research
서비스 소개 홈페이지 연구용 Amazon Lightsail을 사용하면 클라우드의 강력한 컴퓨터에서 연구를 가속화할 수 있습니다. Scilab, RStudio, Jupyter 등 선호하는 연구 애플리케이션이 사전 설치되어 있어 몇 번의 클릭만으로 바로 사용할 수 있습니다. 브라우저를 통해 원격으로 실행되는 애플리케이션에 액세스하고 웹 인터페이스를 통해 가상 컴퓨터에 데이터를 업로드 및 다운로드할 수 있습니다. 가상 컴퓨터를 사용하는 기간 동안 번들 요금만...
AWS CLI
AWS CLI 소개 AWS CLI를 사용하면 명령줄을 사용하여 서비스를 관리하고 스크립트를 통해 서비스를 제어할 수 있습니다. 많은 사용자가 AWS CLI를 사용하여 일정 수준의 자동화를 수행합니다. 최신 버전의 AWS CLI 설치 또는 업데이트는 다음을 참고해주세요. AWS CLI 사용 다음 명령을 사용하여 AWS CLI를 탐색합니다(창을 종료하려면 q를 사용하세요): version general AWS CLI help help related...
데이터 다운로드 실습
실습 데이터 소개 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/?term=SRR6327875 SRA Lite 포멧에 대한 설명 아래 실습을 하는 환경을 다시 설명하자면, Cloud9 환경(EC2 인스턴스)에서 다른 EC2 인스턴스로 SSH 형태로 접속한 환경입니다. (SSH 를 통한 EC2 인스턴스 접속) 실습 데이터 준비 다운로드 cd /mnt/volume1 wget https://sra-downloadb.be-md.n...
유용한 링크들 모음
생명과학 Ramp-Up guide Bioinformatics on AWS Workshops FSx for Lustre, AWS Batch, Step Fucntions 등 관련 서비스와 더불어 간단한 Bioinfo 워크샵
기본 분석 수행하기 (옵션)
Bacterial Genome data 분석 이제 몇 가지 샘플 코드를 실행해 보겠습니다. bwa, samtools 도구가 설치되어 있는지 확인해보겠습니다. which bwa 출력에는 bwa가 설치된 위치가 표시됩니다. which samtools 출력에는 samtools가 설치된 위치가 표시됩니다. Basic Bacterial Genome Sequence Analysis 1. Get a reference sequence: mkdir -p ...
AWS 계정 안전하게 지키기
AWS Well-Architected helps cloud architects build a secure, high-performing, resilient, and efficient infrastructure for their applications and workloads. The Security Baseline Workshop aligns to the security pillar of the AWS Well-Architected Framework. The...
루트 계정 보호하기 - OTP 설정 (필수 영상)
최근 클라우드 환경에서 계정의 OTP 설정은 필수로 자리 매김하고 있습니다. 유명연예인들의 아이폰, 안드로이드의 클라우드 계정 탈취 사건 등 해커들의 계정 탈취 수법은 날로 발전해가고 있습니다. 이와 같은 계정 탈취를 방어하기 위한 OTP 설정은 필수입니다. 5분만 투자하면 OTP 설정을 통해 계정을 더 안전하게 보호할 수 있습니다. 데모와 함께 따라해보세요!
EC2로부터 이미지 (AMI) 생성
EC2 인스턴스 중지 이제 실행 중인 인스턴스를 중지하겠습니다. 계속 진행하기 전에 실행 중인 애플리케이션을 모두 중지하고 데이터가 저장되어 있는지 확인하는 것이 좋습니다. 인스턴스를 중지하는 것은 컴퓨터/서버를 끄는 것과 같습니다. 이미지를 만들기 전에 인스턴스를 중지하는 것이 가장 좋지만 필수는 아닙니다. 그러나 이미지를 만드는 동안 인스턴스가 재부팅되므로 실행 중인 애플리케이션이 없는지 확인해야 합니다. 1. 인스턴스를 중지하면 /tmp가 지워지므로 ...
EC2 종료와 볼륨 스냅샷 저장 (옵션)
클라우드에서 워크로드를 실행할 때 비용은 중요한 고려 사항입니다. 서비스에서 비용이 발생하는 방식을 인식하면 비용을 절감하고 효율적인 워크플로우를 채택하며 현재 워크로드에 더 적합한 정교한 서비스를 사용하는 데 도움이 됩니다. 특정 기능과 서비스의 사용이 어떻게 비용 절감으로 이어질 수 있는지 이해하는 것은 좋은 습관입니다. 이 워크샵 섹션에서는 AWS의 서비스와 관련된 비용에 대해 간략하게 소개하고, EC2 및 EBS와 같은 서비스를 사용하는 특정 서비스에 ...
AMI로 쉽게 리눅스 머신 셋업하기
이제 앞 세션에서 만들어낸 AMI로 부터 새로운 인스턴스를 생성하는 방법을 배우겠습니다. EC2 대시보드 시작 AWS 관리 콘솔 검색 창에 EC2를 입력합니다. EC2를 선택하여 EC2 대시보드를 엽니다. 인스턴스는 그래픽 사용자 인터페이스(콘솔) 또는 명령줄 스크립트를 통해 시작할 수 있습니다. 먼저 EC2 대시보드라고 하는 그래픽 콘솔 인터페이스부터 시작하겠습니다. 대시보드의 레이아웃에 익숙해지는 데 몇 분 정도 시간을 투자하세요: 왼쪽 탐...
워크샵 시작 전 준비사항
실습을 시작하기 전, AWS 계정으로 시작 혹은 AWS WorkShop Studio 시작 두 가지 지침서 중 하나를 선택해서 AWS 서비스를 사용할 계정을 준비합니다. 준비가 완료되면 다음 페이지부터 실습을 진행하면 됩니다. 또한, 실습을 하는 동안 검증된 호환성을 위하여 Mozilla Firefox 또는 Google Chrome Browser 을 사용하기를 권장합니다.
Cloud9
AWS Cloud9는 코드 편집기, 디버거, 터미널이 있는 통합 개발 환경(IDE)입니다. 클라우드에서 가상 서버를 제공하는 웹 서비스인 Amazon Elastic Compute Cloud(EC2)에서 실행됩니다. Cloud9은 EC2 인스턴스의 시작과 종료를 처리하므로 사용자가 직접 할 필요가 없습니다. 또한 Cloud9에는 웹 인터페이스가 있어 SSH와 같은 특수 포트를 사용할 필요 없이 가상 서버에 간편하게 연결할 수 있습니다. Cloud9는 클라우드 애...
Store multimodal data with purpose-built Health AI services
이번 세션에서는 특수 목적의 헬스 AI 서비스(AWS HealthOmics, AWS HealthLake, AWS HealthImaging)로 멀티모달 데이터를 저장할 수 있습니다. 각 데이터 유형 별로 알맞는 서비스에 저장하려면 해당 폴더에 있는 아티팩트를 따르세요. genomic - Run the notebook store-multimodal-data/genomic/store-analyze-genomicdata-with-awshealthomics....