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Recently Updated Pages

개요 및 Executive Summary

Omics on AWS HPP Production Workflows

HPP Production Workflows - AWS 구현 전략 보고서 Executive Summary Human Pangenome Reference Consortium...

Updated 3 months ago by Hyunmin Kim

EFS vs FSx for Lustre 비교 분석 (실제 테스트 결과 포함)

AWS BLAST Performance Testing

BLAST 파일 시스템 성능 비교 테스트 1. 테스트 환경 구성 1.1 인프라 설정 EC2 인스턴스 타입: c5n.9xlarge (36 vCPU, 96GB RAM, 50 G...

Updated 3 months ago by Hyunmin Kim

EBS Snapshot 프로비저닝 성능 분석

AWS BLAST Performance Testing

EBS Snapshot 기반 프로비저닝 성능 분석 작성일: 2026-01-07 리전: ap-northeast-2 (Seoul) 개요 EBS Snapshot 기반으로 EC2 ...

Updated 3 months ago by Hyunmin Kim

EBS 최적화 아키텍처 테스트 결과

AWS BLAST Performance Testing

AWS BLAST EBS 최적화 아키텍처 테스트 결과 테스트 날짜: 2026-01-02 리전: ap-northeast-2 (Seoul) 요약 EBS Snapshot 기반 아...

Updated 4 months ago by Hyunmin Kim

비용 분석 (Cost Analysis)

AWS BLAST Performance Testing

AWS BLAST Performance Testing - Detailed Cost Analysis Region: ap-northeast-2 (Seoul) 1. Amazon ...

Updated 4 months ago by Hyunmin Kim

아키텍처 개요

AWS BLAST Performance Testing

AWS BLAST Performance Testing Architecture Architecture Overview ...

Updated 4 months ago by Hyunmin Kim

AWS HealthOmics에서 Annotation 작업 수행하기

Omics on AWS AWS HealthOmics

AWS HealthOmics variant stores and annotation stores are no longer open to new customers. Existin...

Updated 4 months ago by Hyunmin Kim

Nf-core 워크플로우 마이그레이션 하기 (scrnaseq)

Omics on AWS AWS HealthOmics

참고문서: https://catalog.us-east-1.prod.workshops.aws/workshops/76d4a4ff-fe6f-436a-a1c2-f7ce44bc5d...

Updated 10 months ago by Hyunmin Kim

Nf-core 워크플로우 마이그레이션 하기 (spatialvi)

Omics on AWS AWS HealthOmics

2025년 5월 22일 현재 dev 버전 branch에서 테스트 되었습니다. 연구 목적이며 반드시 실제 샘플과 시나리오상에서 개별적으로 결과데이터와 파이프라인 검증을 필...

Updated 11 months ago by Hyunmin Kim

Example code

Omics on AWS Nextflow

  Python으로 Nextflow 작성하기 import os from textwrap import dedent os.makedirs('workflows/nf/sa...

Updated 11 months ago by Hyunmin Kim

WDL 워크플로우 마이그레이션 하기 (HiFi-human-WGS-WDL)

Omics on AWS AWS HealthOmics

다음 문서는 WDL 워크플로우를 HealthOmics의 Private workflow에 등록하는 내용을 다루고 있습니다. 대상 워크플로우 주소: https://git...

Updated 11 months ago by Hyunmin Kim

Quickstart Hail (English)

Omics on AWS Hail on AWS

Deploy an EMR cluster on AWS, with Spark, Hail, Zeppelin and Ensembl VEP using CloudFormation s...

Updated 11 months ago by Hyunmin Kim

AWS HealthOmics - Troubleshooting

Omics on AWS AWS HealthOmics

    공식문서 https://docs.aws.amazon.com/omics/latest/dev/troubleshooting.html   ECR_PERMISSION_...

Updated 11 months ago by Hyunmin Kim

Nf-core 워크플로우 마이그레이션 하기 (rnaseq)

Omics on AWS AWS HealthOmics

참고 문서: https://catalog.us-east-1.prod.workshops.aws/workshops/76d4a4ff-fe6f-436a-a1c2-f7ce44bc5d1...

Updated 11 months ago by Hyunmin Kim

AWS HealthOmics - Storage

Omics on AWS AWS HealthOmics

오믹스의 스토리지 컴포넌트는 2개가 있습니다. Reference store Sequence stores 이름에서도 알 수 있듯이 레퍼런스 스토어는 1개만 생성이 ...

Updated 11 months ago by Hyunmin Kim

AWS HealthOmics로 유전체 분석 (Fastq to VCF, Annotation) 자동화하기

Omics on AWS AWS HealthOmics

cd aws-healthomics-eventbridge-integration/workflows/vep aws stepfunctions start-execution \ ...

Updated 11 months ago by Hyunmin Kim

Rstudio 실습환경 자동화 구성

대학 고객을 위한 AWS 길라잡이 EC2 따라잡기

Amazon EC2의 Ubuntu 24버전 기준으로 아래 문서를 작성했습니다. 아래 내용은 시간이 지남에 따라 적절히 작동하지 않을 수 있으므로 필요한대로 수정하고 확인하...

Updated 1 year ago by Hyunmin Kim

Troubleshooting for AWS Batch & Nextflow

AWS Batch

CannotPullImageManifestError: Error response from daemon: manifest unknown: manifest unknown  ...

Updated 1 year ago by Hyunmin Kim

Quickstart Hail (Korean)

Omics on AWS Hail on AWS

스택 준비 AWS CLI credential을 준비하고 터미널에서 적용합니다. export AWS_DEFAULT_REGION="us-east-1" export...

Updated 1 year ago by Hyunmin Kim

Tagging w/ Nextflow

AWS Batch

Tagging 소개 태그 (Tag)는 AWS 리소스에 할당하는 레이블입니다. 태그는 키와 값으로 구성되니다. 예를들어 태그를 사용하여 부서, 유형, 애플리케이션 별로 리...

Updated 1 year ago by Hyunmin Kim